寒冷的天氣會帶來一些灌溉管道問題。灌溉管線內的水凍結（并因此膨脹），很大可能性會發生破裂。為防止這種情況，用戶確保在冬季將大部分水排空。同樣，材料越柔軟，它越能承受膨脹和收縮。許多園林綠化者更喜歡在較冷的地區使用聚乙烯管（HDPE管），而在較暖的氣候下更多選擇使用PVC管。

灌溉管路與其他管道操作一樣，有時會遇到內部堵塞。關鍵是要確保流經管路的水得到有效過濾。用生活廢水灌溉特別容易出現問題，使用前的水包含食物殘渣、頭發或其他碎屑。這些沉積物在灌溉管路內積聚會堵塞管道，導致水路系統不通暢。

一些野生動物也會對灌溉管道構成威脅，特別是地鼠和各種嚙齒動物經常咀嚼破壞灌溉管道，這種情況很難避免。

附近比較大的植物也存在一種破壞性，植被樹根會在幾年內對預埋的管道進行擠壓。

修復破裂的灌溉管路的方法通常包括兩個步驟：

隔離一個或多個破損的源頭，修補破損處；更換一節新的管道。先進的灌溉系統采用傳感器來確定流量壓力下降的位置，從而幫助隔離中斷點。該技術對預埋管路系統特別有用。

在沒有這種條件的環境下，管理人員可以目視檢查。管道如果在地面上，流水時應該能夠觀察到泄漏。管道是地下的，泄漏上方的一塊特別潮濕的土壤，通常表明已出現泄漏。接著只需關掉水，開挖故障點，換管段即可。

不同的灌溉管線材料要求使用不同形式的修復。用活接的方式在PE管路上直接擰緊就可得到完美的修復，使用PVC管這就需要使用到專用膠水進行承插式粘合，待膠水干燥之后就可完全再次投入使用。